207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3966 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  94.96 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  94.96 
 
 		 158 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  96.35 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  94.89 
 
 		 137 aa  267  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  95.59 
 
 		 137 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  82.73 
 
 		 151 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  82.01 
 
 		 141 aa  240  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  82.01 
 
 		 141 aa  240  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  82.01 
 
 		 141 aa  240  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  82.01 
 
 		 160 aa  239  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 137 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 137 aa  239  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  82.48 
 
 		 137 aa  237  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  81.62 
 
 		 137 aa  235  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  76.16 
 
 		 160 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  83.21 
 
 		 137 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 169 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  60.31 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  55.88 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  55.88 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  62.7 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  60.48 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  61.29 
 
 		 135 aa  153  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 144 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  51.59 
 
 		 277 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  40.34 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  39.76 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  39.19 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>