251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5962 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  55.47 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  39.37 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  45.79 
 
 		 277 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  39.67 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  40.34 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  40.19 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  33.7 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  36.9 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  33.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.78 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.78 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1624  regulatory protein, MarR  32 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.78 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.78 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.78 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.78 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  33.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.43 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>