260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0954 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  47.14 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  45.33 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  43.62 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  41.72 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 164 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  37.12 
 
 		 139 aa  87  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  30.71 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  30.5 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.7 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  30.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  30.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  31.4 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  24.78 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.95 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.63 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1133  regulatory protein MarR  27.91 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00402057  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1110  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0273499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  30.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  30.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.52 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  30.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  30.63 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  30.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  30.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>