More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0533 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.24 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  40.71 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  34.55 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  34.21 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2559  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  33.62 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  43.21 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  23.95 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  28.76 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  36.07 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0980  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189308 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  32.41 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  43.21 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  24.54 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  25.5 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  30.53 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.93 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  28.18 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  28.18 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  25.34 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  31.07 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>