273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4886 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  48.51 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  49.29 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  45.64 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1408  regulatory protein MarR  34.85 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.247381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1655  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  35.04 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2693  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.618688  normal  0.195885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  34.06 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  34.41 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  33.65 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  26.28 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  29.29 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2164  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  25.83 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.6 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  28.67 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.06 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  24.29 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  29.58 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  25 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>