223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1639 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  44.92 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7125  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  27.72 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 170 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.14 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.37 
 
 		 162 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 151 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  38.16 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  28.89 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03142  putative OhrR transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  31.52 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.946678  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  27.93 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  27.93 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  27.93 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  27.27 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  27.14 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  23.33 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2174  regulatory protein, MarR  28.46 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  27.93 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  27.93 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  29.29 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  38.67 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  29.29 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  32.94 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  23.88 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>