282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0464 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  313  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7125  transcriptional regulator, MarR family  45.08 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  37.37 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  35.09 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  32.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  35 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  32.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.11 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  32.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  35.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  40.26 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  35.35 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  35.35 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  34.31 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  34.31 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  34.31 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  34.31 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  34.31 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  34.31 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  34.31 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  34.31 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  34.31 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  32.99 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  30.59 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.94 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  30.65 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 315 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.49 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  31.11 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  30.25 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  27.35 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  32.99 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03142  putative OhrR transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  32.94 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.946678  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  30.63 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>