More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1718 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
159 aa  320  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
163 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
206 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
145 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  31.52 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 
220 aa  55.1  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  32.97 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  38.78 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  25.93 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.68 
 
 
191 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.99 
 
 
141 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  33.63 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  29.51 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  29.51 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  29.51 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  26.72 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  21.01 
 
 
197 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  36.05 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
145 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
150 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
151 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
183 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  27 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
158 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  39.44 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  30.69 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  29.7 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  25.74 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  26.72 
 
 
187 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
167 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>