216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0469 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  299  8.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  28.71 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  24.83 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 334 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0854  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000058861  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 267 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  23.15 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  24.18 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  27.17 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  24.14 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  27.1 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 145 aa  43.9  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 233 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  27.55 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  26.79 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 352 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>