More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2016 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  341  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3140  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137854  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 201 aa  88.6  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  30.3 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.54 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  29.08 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  30.56 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  28.32 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  25.97 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  28.06 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.59 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  27.61 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  27.61 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  27.61 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  27.61 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  27.61 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 172 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.33 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 321 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.33 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 315 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>