215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3824 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  99.44 
 
 
180 aa  361  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  99.44 
 
 
180 aa  361  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  97.22 
 
 
180 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  46.11 
 
 
195 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0540  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0324  regulatory protein, MarR  22.92 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  30.28 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
155 aa  54.7  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
173 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
160 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
138 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3280  MarR family transcriptional regulator  21.8 
 
 
177 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  0.011902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2144  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0843453  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  24.38 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
152 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
152 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  29.09 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
161 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  29.1 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
139 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
149 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
141 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
141 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
141 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
168 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  26.61 
 
 
137 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
168 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  29.03 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
153 aa  47.8  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
157 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
147 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
137 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
139 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  27.2 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
143 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
143 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
156 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
137 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  24.51 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  25.6 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  29.55 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 
198 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
148 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  23.48 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  32.73 
 
 
168 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
157 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
152 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
181 aa  44.7  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  28.45 
 
 
140 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3135  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
184 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
203 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>