59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5625 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 
170 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  47.57 
 
 
141 aa  83.6  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3253  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
163 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
155 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
258 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.33 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
191 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1790  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
184 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 
139 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
159 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
326 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
336 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 
214 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
144 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2296  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 
186 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2140  regulatory protein, MarR  38.71 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
186 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
186 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.41 
 
 
312 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
186 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4346  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
150 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>