More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0683 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  293  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  56.25 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  57.66 
 
 		 144 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  25.58 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  31.78 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  31.93 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  35.85 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  36.13 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 292 aa  57.4  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.03 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  35.06 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  30.58 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  28.35 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  29.13 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  30.7 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  29.06 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.87 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>