More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4025 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  53.12 
 
 		 178 aa  85.1  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  39.05 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  40.57 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  34.62 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  32.35 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  35 
 
 		 318 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  39.13 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  34.62 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  34.65 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  45.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  48.94 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.63 
 
 		 325 aa  50.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  34.78 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 322 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.45 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>