53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  100 
 
 
135 aa  263  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  29.03 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
148 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  32.94 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  29.35 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  32.53 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2381  MarR family transcriptional regulator  22.68 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2427  regulatory protein MarR  22.68 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.753969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  21.65 
 
 
283 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
202 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  22.88 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  20.62 
 
 
301 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
168 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
148 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0524  transcriptional regulator  23.6 
 
 
146 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0172488  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
180 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  30.3 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
160 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  23.46 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
183 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
160 aa  40  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>