191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4409 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  335  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 144 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  26.5 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  32.99 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  25.38 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  28.87 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  23.15 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  22.13 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  23.89 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  24.47 
 
 		 128 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  24.07 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.68 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  23.62 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  21.1 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2971  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 334 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  26.97 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  22.61 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 		 132 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>