80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0218 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  283  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  90.28 
 
 		 144 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  49.47 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 		 182 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 180 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  42.07 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  48.25 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  38.35 
 
 		 155 aa  88.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 202 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 179 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  43.3 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  48.94 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  48.94 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 189 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  34.69 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  36.22 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  32.63 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 169 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 177 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 162 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 154 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 164 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  31.31 
 
 		 162 aa  40.8  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 275 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  26.51 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.94 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.94 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 162 aa  40  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.94 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.94 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  31.94 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  28.44 
 
 		 154 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 277 aa  40  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>