90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2732 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  68.06 
 
 		 157 aa  188  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  68.42 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  30.22 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  32.26 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  27.16 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  27.22 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  37.14 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  30.6 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  25.64 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 145 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 158 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 167 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  29.76 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  28.03 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.91 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  28.03 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  25.53 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  31.94 
 
 		 171 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  25.88 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>