210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3934 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  297  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 180 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  54.7 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  44.08 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 179 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  61.8 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  61.8 
 
 		 172 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  41.61 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  43.61 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  50 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 182 aa  90.1  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 155 aa  84.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  54.22 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  51.81 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  34.97 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  43.37 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  40.74 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  32 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  31.78 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  35.8 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.15 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  28.45 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  28.93 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  26.6 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>