152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3659 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  303  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  62.5 
 
 		 172 aa  146  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  61.84 
 
 		 163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  48.98 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 202 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  46.04 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 167 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 180 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 120 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 189 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 148 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  44.93 
 
 		 182 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  44.27 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  50.49 
 
 		 147 aa  90.5  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 		 144 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  46.46 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  39.85 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  34.55 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 85 aa  51.2  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 138 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  29.32 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.71 
 
 		 283 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  31.36 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0297  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  22.31 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  40.43 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 		 301 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  34.04 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>