More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4486 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
147 aa  277  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  40.44 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0188  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 
184 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
167 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
411 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  35.16 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.78 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
162 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
303 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  39.18 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  21.55 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
145 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
158 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
158 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
142 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  34.34 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 
167 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.58 
 
 
178 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  30 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>