107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1619 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3835  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.04 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2381  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2427  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.753969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  25.38 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  25.27 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  30.86 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  31.46 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 120 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 187 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 158 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  24.17 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  31.88 
 
 		 172 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3908  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  23.97 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  29.59 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  26.45 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>