58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2725 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  307  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  57.45 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  58.16 
 
 		 144 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  42.86 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 179 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  43.41 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 202 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  41.13 
 
 		 143 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  34.62 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  34.07 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  42.57 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 189 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  34.85 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  30.77 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  30.77 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 156 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 		 156 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 171 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  27.55 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  30.95 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>