More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3441 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 168 aa  228  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  64.6 
 
 		 171 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  64.6 
 
 		 171 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  61.59 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  63.57 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 155 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  55.24 
 
 		 158 aa  164  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 147 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  35.71 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  29.46 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  32 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  32.26 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  34.34 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.57 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.58 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  28.03 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  28.91 
 
 		 134 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  28.91 
 
 		 134 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  28.91 
 
 		 134 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  28.91 
 
 		 134 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  34.74 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  32.35 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  33 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2620  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>