More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4139 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  42.96 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  41.74 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  38.46 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  36.52 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 174 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  46.96 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 167 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  33.93 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.23 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  33.64 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  29.17 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 175 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  28.67 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  29.91 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  28.12 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  27.48 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  29.1 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 303 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  27.56 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>