139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3564 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  296  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  73.33 
 
 		 152 aa  211  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  70.2 
 
 		 152 aa  202  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  59.18 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  48.89 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  31.34 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  34.33 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  36.92 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  32.46 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  23.61 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  26.19 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  24.81 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 180 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  34.26 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.63 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 143 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  18.66 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.97 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 145 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 149 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 310 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 164 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>