201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2043 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  347  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  21.17 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  26.98 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  29.17 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  31.07 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 128 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  33.67 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  29.29 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 162 aa  47.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  27.18 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.34 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.34 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 158 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 167 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  28.87 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>