More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4454 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  270  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  270  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  98.56 
 
 		 139 aa  265  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  68.38 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  65.94 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 141 aa  159  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  58.96 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5859  MarR family transcriptional regulator  74.39 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  41.27 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  45.16 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5857  MarR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0150711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 347 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 326 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 347 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 340 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 349 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 340 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.72 
 
 		 349 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  26.45 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.87 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 309 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 144 aa  47.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 320 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  36 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 307 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  35.34 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  35.44 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30.93 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.53 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.53 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  34.58 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  42.11 
 
 		 287 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  40.54 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>