75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8638 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 159 aa  317  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  70.25 
 
 		 158 aa  220  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  65.41 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  45.27 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  30.52 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  21.1 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 340 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 340 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  32.35 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 309 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 313 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 320 aa  43.9  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  36.07 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 143 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 349 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26 
 
 		 349 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 172 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 347 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 347 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  27.78 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  32.73 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>