35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2864 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  71.43 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4367  transcriptional regulator, MarR family  57.58 
 
 		 162 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  49.03 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  45.03 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  42.14 
 
 		 154 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 323 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 140 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 151 aa  47.8  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  36.92 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  23.74 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.86 
 
 		 338 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.91 
 
 		 314 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.64 
 
 		 318 aa  42.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 178 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>