33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4367 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4367  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  58.02 
 
 		 188 aa  168  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 		 191 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  48.99 
 
 		 188 aa  150  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  34.06 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 345 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  21.43 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.9 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  40.68 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  32.84 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 156 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 156 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.89 
 
 		 338 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>