33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4357 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
188 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4367  transcriptional regulator, MarR family  48.99 
 
 
162 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2864  transcriptional regulator, MarR family  49.03 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  47.65 
 
 
191 aa  135  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
159 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  33.11 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
165 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.67 
 
 
318 aa  57.4  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
345 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.2 
 
 
316 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
155 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
149 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.45 
 
 
338 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  35.71 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  33.85 
 
 
148 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 
137 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 
153 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  29.68 
 
 
208 aa  44.7  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
150 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.5 
 
 
319 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
150 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
324 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 
140 aa  41.2  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
136 aa  41.2  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
170 aa  41.2  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>