126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2571 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 
314 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.75 
 
 
316 aa  235  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 
345 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.74 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.96 
 
 
318 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  51.9 
 
 
161 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  57.79 
 
 
156 aa  175  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
324 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  43.04 
 
 
310 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09031  transcriptional regulator, MarR family protein  43.05 
 
 
151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  26.93 
 
 
327 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  43.23 
 
 
160 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
168 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  38.62 
 
 
184 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.3 
 
 
338 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 
166 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 
161 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.99 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 
189 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  36.59 
 
 
164 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
162 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
142 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0441  acetyltransferase, gnat family  32.39 
 
 
167 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
168 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  25.22 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 
153 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
141 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.14 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
154 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
162 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
144 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 
151 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3540  regulatory protein MarR  23.08 
 
 
154 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.074778  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2483  acetyltransferase  31.33 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.022509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2445  acetyltransferase  31.33 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000291129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2667  acetyltransferase  31.33 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 
144 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
196 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4797  acetyltransferase, gnat family  31.69 
 
 
163 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.51 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4824  acetyltransferase  31.47 
 
 
163 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  28.93 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2246  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
168 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.886105  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2732  acetyltransferase, GNAT family  30.12 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  31.82 
 
 
152 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
148 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0630  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.66 
 
 
188 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1253  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
144 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2702  acetyltransferase  30.12 
 
 
266 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.21 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  29.1 
 
 
161 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
160 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
168 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  39.34 
 
 
166 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
152 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 
161 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4018  acetyltransferase  26.92 
 
 
142 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565073  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
161 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1815  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
142 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2681  acetyltransferase, GNAT family  30.12 
 
 
242 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000458836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  30.51 
 
 
165 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34630  acetyltransferase  35 
 
 
212 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
185 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
165 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
195 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  32.67 
 
 
169 aa  45.8  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0125  hypothetical protein  30.23 
 
 
154 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
147 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  37.1 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  37.1 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4819  acetyltransferase, gnat family  31.47 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.866921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  35.48 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4589  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
167 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  35.48 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4326  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
166 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  35.48 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  35.48 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
163 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  35.48 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  34.78 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  37.1 
 
 
146 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.28 
 
 
149 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  37.1 
 
 
146 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  37.1 
 
 
146 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  35.48 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
162 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
165 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
191 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3661  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>