116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1863 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  341  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1875  hypothetical protein  30.83 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  32.48 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  29.06 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  29.06 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  29.06 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  29.06 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  29.06 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  29.06 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  30.85 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  29.06 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  28.21 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0540  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  29.52 
 
 		 161 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 145 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 165 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 155 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 185 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 153 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 153 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 174 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 150 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 187 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 190 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  28.21 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 202 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>