102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2244 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2244  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 180 aa  374  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  43.07 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1946  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00612369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  31.58 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1482  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0469  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  22.92 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1629  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000386217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0987  transcriptional regulator  23.64 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000387404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 138 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1332  MarR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  28.18 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  23.39 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  24.11 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  27.91 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 151 aa  44.3  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  22.54 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  23.13 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  31.76 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  23.21 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 145 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 161 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 142 aa  42  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.41 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  28.28 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  21.54 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>