136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1341 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1341  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 
152 aa  298  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  49.24 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2307  transcriptional regulator, TrmB  46.05 
 
 
164 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  36.55 
 
 
172 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  22.48 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  27.61 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  19.7 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
166 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  22 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  21.32 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  19.57 
 
 
187 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  18.9 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
192 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 
192 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  22.06 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  29.07 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  20.93 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  20.14 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  21.37 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
201 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  30.53 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  19.85 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  22.31 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  20.91 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
193 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  23.39 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  19.53 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  22.52 
 
 
191 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  22.69 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
172 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
172 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
172 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
168 aa  43.9  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  22.68 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  23.53 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  20.54 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  25.47 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  25 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>