199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2380 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 132 aa  263  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2307  transcriptional regulator, TrmB  50.76 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1341  transcriptional regulator, TrmB  49.24 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 172 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  27.91 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  29.06 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28.21 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 173 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  27.93 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  29.13 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  27.93 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  27.93 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  27.93 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  21.78 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  29.59 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  28.18 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  26.4 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  31.03 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  24.58 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  23.42 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  27.03 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  22.11 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  23 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  20.35 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  27 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  25.23 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>