More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2307 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2307  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 164 aa  337  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  50.76 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1341  transcriptional regulator, TrmB  46.05 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  24.77 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  18.35 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  23.81 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.73 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  22 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  22 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  26.79 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  23.48 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  24.78 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 224 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  19.02 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  22.68 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  24.79 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  29.46 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  23.97 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  27.62 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  21.3 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  23.76 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  22.88 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  25.89 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  25.89 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  27.74 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.32 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  25.89 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  27.68 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  28.16 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  25 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 116 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  18.42 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>