177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32210 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  100 
 
 		 92 aa  190  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  71.74 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  68.48 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  73.91 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  45.98 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  45.98 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  45.98 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  45.98 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  48.72 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  48.72 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  48.72 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  48.72 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  48.72 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  40 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  40 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  40 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  37.78 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  37.78 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.89 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  32.61 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.17 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  34.94 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.71 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  25 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.97 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 172 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>