232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8231 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 167 aa  326  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  70.48 
 
 		 162 aa  227  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  74.83 
 
 		 159 aa  223  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  41.24 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  29.08 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  33.61 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 151 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  27.59 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  31.67 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.51 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 193 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  30.95 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  34.82 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.87 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  28.95 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  26.83 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  26.83 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  26.83 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  34.78 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  26.83 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  26.83 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  30.59 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  32.47 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  26.83 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  26.83 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  27.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  26.83 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>