More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6948 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  317  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  42.22 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  40.13 
 
 		 172 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  37.6 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.47 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.78 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31.61 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  33.59 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  31.9 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  41.11 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  34.65 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.06 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.63 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  35.96 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.75 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31.82 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  28.81 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5564  regulatory protein, MarR  34.65 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  30.61 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.58 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  34.83 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  34.83 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 201 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  34.29 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  27.83 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  34.29 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  34.29 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  28.15 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  30.93 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>