16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0020 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  569  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  86.25 
 
 
290 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  56.55 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  62.88 
 
 
246 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0833  hypothetical protein  61.59 
 
 
213 aa  162  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  43.81 
 
 
169 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  27.16 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  37.33 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0198  transcriptional regulator, TrmB  29.35 
 
 
305 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.613545  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  47.62 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  25.4 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  40.3 
 
 
116 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
118 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  35.14 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  43.64 
 
 
114 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 
117 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.872668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>