16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1374 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1048  Fis family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 287 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.246642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1547  hypothetical protein  65.79 
 
 		 246 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0933  hypothetical protein  68.12 
 
 		 290 aa  105  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.846552  hitchhiker  0.0043077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0020  hypothetical protein  70.77 
 
 		 290 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0572  solute binding protein-like protein  36.51 
 
 		 344 aa  54.3  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1111  hypothetical protein  39.06 
 
 		 303 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2070  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 114 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0725  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 117 aa  50.8  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.872668 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1260  hypothetical protein  41.94 
 
 		 274 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2298  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00618378 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1940  transcriptional regulator, TrmB  38.18 
 
 		 116 aa  48.9  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.600204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1776  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 		 307 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0136034  normal  0.0115513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1250  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 		 310 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.727025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0346  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 313 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 107 aa  42.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>