95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1076 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  50.67 
 
 		 316 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  47.08 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  48.28 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  43.39 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  44.39 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  44.93 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  38.62 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  36.31 
 
 		 169 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  40.14 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  38.55 
 
 		 169 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  38 
 
 		 155 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  41.26 
 
 		 150 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  32.17 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 159 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 159 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  34.07 
 
 		 159 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  33.11 
 
 		 153 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  31.16 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  27.54 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  33.06 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0959  hypothetical protein  61.4 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.498536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  34.23 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  34.18 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 386 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  45.07 
 
 		 386 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 370 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  43.66 
 
 		 386 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  27.92 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  28.33 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  43.28 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 385 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 385 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  41.79 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  25.76 
 
 		 157 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  43.66 
 
 		 386 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  51.02 
 
 		 343 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  37.97 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  30.13 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  52.08 
 
 		 385 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  32.91 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  27.94 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  40.3 
 
 		 380 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  27.15 
 
 		 160 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  30.56 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 386 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  50 
 
 		 466 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  43.08 
 
 		 374 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  42.86 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 465 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 465 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 465 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 465 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 465 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 465 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  30.6 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  32.94 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  42.47 
 
 		 465 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  43.08 
 
 		 374 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  43.08 
 
 		 383 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  43.08 
 
 		 383 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  43.08 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  43.08 
 
 		 383 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  43.08 
 
 		 383 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  43.08 
 
 		 383 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  30.77 
 
 		 386 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  43.08 
 
 		 383 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  43.08 
 
 		 383 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 317 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3886  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  43.08 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 335 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  26.77 
 
 		 175 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  48.08 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  42.86 
 
 		 385 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  42.86 
 
 		 385 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  29.01 
 
 		 155 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  42.62 
 
 		 342 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  42.62 
 
 		 386 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  25 
 
 		 163 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  44.93 
 
 		 401 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>