More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3408 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  99.69 
 
 		 374 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  100 
 
 		 383 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  99.69 
 
 		 383 aa  654    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  100 
 
 		 383 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  99.69 
 
 		 374 aa  651    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  100 
 
 		 383 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  100 
 
 		 383 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  100 
 
 		 383 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  100 
 
 		 383 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  100 
 
 		 320 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  99.62 
 
 		 354 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3886  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  98.41 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  50.78 
 
 		 385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  50.47 
 
 		 385 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  50.16 
 
 		 385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  47.34 
 
 		 370 aa  288  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  47 
 
 		 386 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  47 
 
 		 386 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  46.71 
 
 		 386 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  45.25 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  44.62 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  44.3 
 
 		 386 aa  265  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  44.3 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  45.25 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  43.99 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  47.86 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  42.99 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 409 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1311  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  99.01 
 
 		 103 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4210  integrase  42.8 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  43.12 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  43.12 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  43.12 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1540  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4088  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  41.51 
 
 		 519 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2955  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0298669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1842  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1134  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  41.51 
 
 		 519 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  41.51 
 
 		 496 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1947  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.666461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2697  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  41.51 
 
 		 519 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  41.51 
 
 		 519 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3459  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00200761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  35.8 
 
 		 479 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  35.8 
 
 		 479 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  35.8 
 
 		 479 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  41.51 
 
 		 519 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  41.51 
 
 		 525 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  35.5 
 
 		 453 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4055  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3879  Integrase catalytic region  40.73 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  39.05 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17810  transposase, IS30 family  33.43 
 
 		 465 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3475  hypothetical protein  36.08 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.214234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  33.87 
 
 		 466 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 466 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2519  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  35.01 
 
 		 480 aa  172  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  35.01 
 
 		 480 aa  172  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  32.43 
 
 		 474 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  32.43 
 
 		 474 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  32.43 
 
 		 474 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0560  IS30 family transposase  41.85 
 
 		 423 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.404036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1270  IS30 family transposase  41.85 
 
 		 423 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0058  IS30 family transposase  41.85 
 
 		 423 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0255  IS30 family transposase  41.85 
 
 		 423 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0508  IS30 family transposase  41.85 
 
 		 423 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  37.58 
 
 		 421 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  35.2 
 
 		 385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  35.03 
 
 		 466 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  39.63 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  35.2 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>