30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0868 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  35.06 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  31.21 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  27.06 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  30.52 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  37.66 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  28.91 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  29.56 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  23.75 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4777  ArsR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  24.31 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  26.85 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  26.85 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  32.56 
 
 		 175 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  23.93 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  22.6 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  21.77 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  32.94 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  26.85 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  21.38 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  19.86 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  25.93 
 
 		 186 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  24.53 
 
 		 183 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  25.17 
 
 		 194 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1048  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  21.92 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>