42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0176 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  316  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  90.2 
 
 		 153 aa  291  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  36.73 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  37.93 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  31.29 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  33.1 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  35.38 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  32.31 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  29.93 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  26.39 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  33.56 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  31.21 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  33.1 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  34.13 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  25.49 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  31.21 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  31.39 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  31.39 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  27.89 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  31.39 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  28 
 
 		 179 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  27.08 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  27.21 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  27.52 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  28.17 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  27.15 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 237 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  27.92 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  27.89 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  26.67 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  21.05 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  26.67 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  22.67 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 178 aa  43.9  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  26.12 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2135  hypothetical protein  27.13 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.421336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>