32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0167 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  38.1 
 
 		 164 aa  91.3  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  37.69 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  36.05 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  36.42 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  34.29 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  35.53 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  30.26 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  30.6 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  33.56 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  33.06 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  29.58 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  32.45 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  34 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  27.45 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  30.08 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  26.11 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  30.08 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  30.08 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  27.14 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  27.54 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  30.77 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  31.21 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  27.12 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  26.42 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  29.41 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  30.72 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  27.08 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  27.08 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  26.62 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  30.6 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  28.4 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>