48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3663 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  317  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  38.3 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  40.71 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  34.09 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  33.09 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  35.34 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  32.31 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  28.68 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  26.92 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  30.37 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  30.6 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  31.01 
 
 		 179 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  28.89 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  28.06 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  33.94 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  25.98 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  33.03 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  26.77 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  23.62 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  25.98 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  27.08 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  31.31 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  24.31 
 
 		 316 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  28.33 
 
 		 239 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  25.16 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  27.47 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  24.47 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  23.93 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  28.03 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  23.08 
 
 		 232 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  23.62 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 180 aa  43.9  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  28.21 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  27.94 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  25.17 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  26.61 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  30.56 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  25.35 
 
 		 244 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>