79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0584 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 155 aa  318  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  30.87 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  31.08 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  29.3 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  30.71 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  26.32 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  34.34 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  37.35 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  25.93 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  29.73 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  26.06 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  36.49 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  31.31 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  30.33 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7088  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  27.62 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.688965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  31.71 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0396  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  30.95 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0868  hypothetical protein  37.66 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0439  transcriptional regulators-like protein  31.65 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179863  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  27.15 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  31.75 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  32.93 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  26.76 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  32.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  25 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  23.74 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  28.1 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  25.17 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 193 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  35.48 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  34.07 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  25.83 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  28.1 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  27.81 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  32.91 
 
 		 239 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  34.62 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  34.09 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  28.41 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2885  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  25 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  29.73 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  30.1 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  26.83 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  26.57 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  22.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  20.93 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0589  putative transcriptional regulator  26.97 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  25.93 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  25.61 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  28.05 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  27.73 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  26.83 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  29.33 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  22.9 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  22.9 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  22.9 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  29.63 
 
 		 201 aa  44.3  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  31.17 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  26.62 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4210  regulatory protein, ArsR  30.65 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.204887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  20.25 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  25.97 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  26.4 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  30.65 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5408  transcriptional regulators-like  26.17 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5453  transcriptional regulators-like protein  26.17 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4816  transcriptional regulators-like protein  26.17 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912627  normal  0.635588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>